Ideen til et større kornmottak og mølle på Flisa ble unfanget av Bondelaget og dets leder Per Rostad i 1952. Men det skulle gå helt til 21 mars 1959 før Flisa Mølle A/L ble stiftet. Det ble jobbet videre med planene og i 1961 ble det lagt et betydelig press på Statens Kornforretning for å få på plass et anlegg. I 1963 stod den første delen av anlegget nede ved Glomma klar. Kapasiteten var 1500 tonn korn og tørking av 10 tonn pr time. I 1964 stod den første mølla klar. I 1967 stod det første kraftfôrblanderiet klart.

I 1968 var det klart for den første utvidelsen og kornmottaket fikk en kapasitet på 4000 tonn med tørkekapasitet på 17,5 tonn pr time. Dette ble etterfulgt av 2 stålsiloer hver på 500 tonn i 1971, og deretter 2 betongsiloer hver på 2000 tonn i 1974.

I 1982 ble et helt nytt kornanlegg med mottak og biobrenselannlegg tatt i bruk i tillegg til det gamle anlegget. Derfra har det vært en teoretisk kapasitet på ca 20 000 tonn korn.

I 2001 stod en ny kraftfôr fabrikk klar og i 2006 ble det kompletert med et avskallingsanlegg for havre.

Etter en turbulent periode med økonomiske problemer mobliserte de lokale krefter og bidro med 3 mill på kort varsel og dette sammen med Fiskå Mølle AS og Sparebanken Hedmark sin finasielle støtte muliggjorde en refinansiering og restrukturering til et aksjeselskap; Flisa Mølle og Kornsilo AS. Pr 31 des 2007 hadde Flisa Mølle og Kornsilo AS 600 aksjonærer. De aller fleste av disse hadde vært andelseiere i det gamle andelslaget.